微生物吸收紫外线后导致细胞内核蛋白分子结构发生变化，产生蛋白变性，DNA链断裂，DNA分子间的交联被破坏，胞嘧啶和发生水合作用，出现腺嘧啶二聚体，二聚体的形成破坏了嘌呤和嘧啶的正常配对，从而改变了DNA的生物活性。结果带来微生物新陈代谢的障碍，不能增殖并产生细胞破坏作用;引起菌体内蛋白质和酶的合成障碍，导致结构发生变异，功能遭到破坏，致使微生物死亡，从而达到消毒灭菌的目的。实践证明紫外线在波长为240nm----280nm范围有杀菌效能，尤其在波长为253.7nm时紫外线的杀菌作用。紫外线中的一段C频(C-BAQND)对摧毁对人体有害的细菌或病毒有极大的效用。紫外线能杀灭细菌、霉菌、病毒和单胞藻，所以紫外线是水处理行业杀菌消毒的设备。