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水质自动监测指标包含：COD、氨氮、总磷、总氮、重金属等物质，水质在线监测系统由电动阀门，流量计，采样单元，预处理单元、分析监测单元，超标留样装置，通信传输单元，总量控制单元、远程监控中心等构成。流量计完成污水流量测量；采样单元、预处理单元完成水质自动监测的水样采集、水样预处理等采样控制过程；分析监测单元完成水质监测参数的分析过程；超标留样装置收集超标水样，提供手工比对条件；通信传输单元实现数据及控制指令的上行及下行传输过程，数据及时传至相关监管部门；总量控制单元实现流量与浓度的同步控制；指挥中心实时接收数据并进行数据分析。

水质自动监测系统有多种监测手段，从标准地表水水质自动监测站到污水在线监测站、再到小型水站、微型水站、浮标站等形式，应对各种监测需求。